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继谷歌之后,亚马逊加入NIH的STRIDES计划推动生物医学大数据研究|威尼斯wns.8885556
发布时间:2024-12-25
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本文摘要:2018年10月25日,动脉网得知,AWS(亚马逊网络服务)将重新加入NIH(美国国立公共卫生研究院)STRIDES(找到、实验和可持续性的科学和技术研究基础设施)计划,利用AWS云端的先进设备技术增进生物医学的创意研究。

2018年10月25日,动脉网得知,AWS(亚马逊网络服务)将重新加入NIH(美国国立公共卫生研究院)STRIDES(找到、实验和可持续性的科学和技术研究基础设施)计划,利用AWS云端的先进设备技术增进生物医学的创意研究。STRIDES计划于2018年7月发售,目的为NIH生物医学研究人员获取商业云计算服务。

最初,NIH的工作重点是协助研究人员取得低价值数据集,并尝试用新的方法来优化技术密集型研究。STRIDES计划是NIH联合基金数据管理新模式(NMDS)的组成部分,NMDS的另一组成部分是NIH数据共享测试计划,该计划目的测试将低价值生物医学数据集划入云计算系统,创建和评估用于数据的最佳方法。AWS是时隔GoogleCloud之后重新加入STRIDES计划的第二家云服务提供商。AWS是亚马逊的子公司,它以收费订阅者的方式向政府、公司和个人获取按须要云计算平台服务,该服务一直容许订阅者用户通过网络采访虚拟世界计算机数据集。

NIH与AWS达成协议的协议将协助NIH研究人员以及全国2500多所学术机构的研究人员取得NIH的资助以及AWS的一系列技术。STRIDES项目的负责人期望通过与AWS这类的商业云服务提供商(CSP)合作获取的数据需要超过生物医学研究界接纳的可查询、可采访、可互操作和可器重(FAIR)的标准。他们还期望AWS必要与NIH及其资助的研究人员合作,研发和测试新的方法,重新组建更好的数据集和涉及的计算出来工具,可供更加普遍的研究群体用于和采访。

CSP和NIH数据共享测试阶段的研究人员将为三个测试用数据集创建云存储服务,同时设置准则、制度和流程。在已完成一系列试点计划以及修改该计划的制度和程序后,这项服务将获取给NIH资助的研究机构。NIH资助的三个测试用数据集是基于他们在生物医学研究界的价值、数据的多样性以及基础研究和临床研究的覆盖率而要求的。

目前,这三个数据集还包括以下内容:基因型——的组织传达(GTEx)数据集,GTEx数据集探寻人类基因在有所不同的组织中的传达和调控方式,以及基因组变异在转变基因表达中的起到;基因组资源整合(AGR),AGR数据集由6个MOD(模型生物数据库)构成,MOD为模式生物的深度研究获取深层次的生物学数据;精准医学的Trans-Omics(TOPMed),TOPMed数据集搜集并筛选仅有基因组测序(WGS)。


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